Клинический разбор в общей медицине

Clinical review for general practice
ISSN (Print) 2713-2552
ISSN (Online) 2782-5671
  • Главная
  • О журнале
  • Архив
  • Контакты
Левый блок
Полноэкранный режим > Архив > 2025 > Том 6, №9 (2025) > Оценка метилирования группы генов в диагностике гидроторакса

Оценка метилирования группы генов в диагностике гидроторакса

Для цитирования:


  • Аннотация
  • Об авторе
  • Список литературы

Аннотация

В последнее время особое внимание уделяется развитию новых методов диагностики с использованием молекулярных биомаркеров, в том числе изучению метилирования ДНК. Одним из способов улучшить диагностику гидроторакса неясного генеза может быть метод жидкостной биопсии, при которой предполагается исследование материалов, связанных с раком (т.е. бесклеточной ДНК, белков, экзосом), из крови или других биологических жидкостей. Так, определение метилирования генов SHOX2 и уровня эмбрионального опухолевого антигена (CEA) в плевральном выпоте имеет высокую диагностическую ценность для выявления причин развития гидроторакса. Метилирование промотора RARβ отмечается при ряде опухолей, включая рак легких, молочной железы и пищевода, а также плоскоклеточный рак головы и шеи. Метилирование гена DAPK-1 отмечали при онкологических заболеваниях полости рта, а также при карциноме желчных протоков, В-клеточной лимфоме и раке желудка и кишечника. Метилирование miR-375 отмечали при раке предстательной железы, раке прямой кишки и раке молочной железы. Таким образом, возможно применение исследования метилирования вышеописанной группы генов наряду с рутинными общепринятыми методами для сокращения сроков диагностики и как можно более раннего начала терапии, что соответствует как интересам пациента, так и экономическим интересам системы здравоохранения. 
Ключевые слова: гидроторакс, метилирование группы генов, SHOX2, RARβ, DAPK-1, miR-375.

Об авторе

В.Е. Покровский1, А.Н. Федосеев1, В.В. Смирнов1, С.М. Сороколетов2 

1 ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр специализированных видов медицинской помощи и медицинских технологий ФМБА», Москва, Россия; 
2 ГБУЗ «Московский многопрофильный научно-клинический центр им. С.П. Боткина» Департамента здравоохранения города Москвы, Москва, Россия
vasiliy.pokrovsky@gmail.com

Список литературы

1. Schwarzenbach H, Hoon DS, Pantel K. Cell-free nucleic acids as biomarkers in cancer patients. Nat Rev Cancer 2011;11:426-37. 
2. Wan JCM, Massie C, Garcia-Corbacho J et al. Liquid biopsies come of age: towards implementation of circulating tumour DNA. Nat Rev Cancer 2017;17:223-38. 
3. Snyder MW, Kircher M, Hill AJ et al. Cell-free DNA Comprises an In Vivo Nucleosome Footprint that Informs Its Tissues-Of-Origin. Cell 2016;164:57-68. 
4. Moss J, Magenheim J, Neiman D et al. Comprehensive human cell-type methylation atlas reveals origins of circulating cell-free DNA in health and disease. Nat Commun 2018;9:5068. 
5. Bettegowda C, Sausen M, Leary RJ et al. Detection of circulating tumor DNA in early-and late-stage human malignancies. Sci Transl Med 2014;6:224ra24. 
6. Diehl F, Li M, Dressman D et al. Detection and quantification of mutations in the plasma of patients with colorectal tumors. Proc Natl Acad Sci USA 2005;102:16368-73. 
7. Jahr S, Hentze H, Englisch S et al. DNA fragments in the blood plasma of cancer patients: quantitations and evidence for their origin from apoptotic and necrotic cells. Cancer Res 2001;61:1659-65. 
8. Zou H, Allawi H, Cao X et al. Quantification of methylated markers with a multiplex methylation-specific technology. Clin Chem 2012;58:375-83. 
9. Novak P, Jensen T, Oshiro MM et al. Agglomerative epigenetic aberrations are a common event in human breast cancer. Cancer Res 2008;68:8616-25. 
10. Rauch TA, Zhong X, Wu X et al. High-resolution mapping of DNA hypermethylation and hypomethylation in lung cancer. Proc Natl Acad Sci USA 2008;105:252-7. 
11. Shames DS, Girard L, Gao B et al. A genome-wide screen for promoter methylation in lung cancer identifies novel methylation markers for multiple malignancies. PLoS Med 2006;3:e486 
12. Eads CA, Danenberg KD, Kawakami K et al. MethyLight: a high-throughput assay to measure DNA methylation. Nucleic Acids Res 2000;28:E32. 
13. Bixby B, Vrba L, Lenka J et al. Cell-Free DNA Methylation Analysis as a Marker of Malignancy in Pleural Fluid. Res Sq 2023;Oct 9:rs.3.rs-3390107. DOI: 10.21203/rs.3.rs-3390107/v1 
14. Vrba L, Oshiro MM, Kim SS et al. DNA methylation biomarkers discovered in silico detect cancer in liquid biopsies from non-small cell lung cancer patients. Epigenetics 2020;15:419-30. 
15. Schmidt B, Liebenberg V, Dietrich D et al. SHOX2 DNA methylation is a biomarker for the diagnosis of lung cancer based on bronchial aspirates. BMC Cancer 2010;10:600. 
16. Dietrich D, Hasinger O, Liebenberg V et al. DNA methylation of the homeobox genes PITX2 and SHOX2 predicts outcome in non-small-cell lung cancer patients. Diagn Mol Pathol 2012;21(2):93-104. 
17. Weiss G, Schlegel A, Kottwitz D et al. Validation of the SHOX2/PTGER4 DNA Methylation Marker Panel for Plasma-Based Discrimination between Patients with Malignant and Nonmalignant Lung Disease. J Thorac Oncol 2017;12(1):77-84. 
18. Chen S, Huang K, Zou L et al. Diagnostic value of SHOX2, RASSF1A gene methylation combined with CEA level detection in malignant pleural effusion. BMC Pulm Med 2023;23(1):160. 
19. Chambon P. A decade of molecular biology of retinoic acid receptors. FASEB J 1996. 10:940-54. 
20. Lotan R, Xu XC, Lippman SM et al. Suppression of retinoic acid receptor-beta in premalignant oral lesions and its up-regulation by isotretinoin. N Engl J Med 1995;332:1405-10. 
21. Picard E, Seguin C, Monhoven N et al. Expression of retinoid receptor genes and proteins in non-small-cell lung cancer. J Natl Cancer Inst 1999;91:1059-66. 
22. Qiu H, Zhang W, El-Naggar AK et al. Loss of retinoic acid receptor-beta expression is an early event during esophageal carcinogenesis. Am J Pathol 1999;155:1519-23. 
23. Xu XC, Sneige N, Liu X et al. Progressive decrease in nuclear retinoic acid receptor beta messenger RNA level during breast carcinogenesis. Cancer Res 1997;57:4992-6. 
24. Lotan Y, Xu XC, Shalev M et al. Differential expression of nuclear retinoid receptors in normal and malignant prostates. J Clin Oncol 2000;18:116-21. 
25. Sun SY, Wan H, Yue P et al. Evidence that retinoic acid receptor beta induction by retinoids is important for tumor cell growth inhibition. J Biol Chem 2000;275:17149-53. 
26. Baust C, Redpath L, and Schwarz E. Different ligand responsiveness of human retinoic-acid-receptor beta-gene transcription in tumorigenic and non-tumorigenic cervical-carcinoma-derived cell lines is mediated through a large retinoic-acid-response domain. Int J Cancer 1996;67:409-16. 
27. van der Leede BJ, Folkers GE, Kruyt FA, van der Saag PT. Genomic organization of the human retinoic acid receptor β2. Biochem Biophys Res Commun 1992;188:695-702. 
28. Jones PL, Veenstra GJ, Wade PA et al. Methylated DNA and MeCP2 recruit histone deacetylase to repress transcription. Nat Genet 1998;19:187-91. 
29. Papadopoulos P, Zisis V, Andreadis D et al. Methylation Profile of DAPK-1 Between Oral Potentially Malignant Disorders and Oral Squamous Cell Carcinoma. DNA 2024;4:494-506. 
30. Asiaf A, Ahmad S, Malik A et al. Association of Protein Expression and Methylation of DAPK1 with Clinicopathological Features in Invasive Ductal Carcinoma Patients from Kashmir Asian. Pac J Cancer Prev 2019;20(3):839-48. 
31. Kristensen LS, Asmar F, Dimopoulos K et al. Hypermethylation of DAPK1 is an independent prognostic factor predicting survival in diffuse large B-cell lymphoma Oncotarget 2014;5:9798-810. 
32. Yuan W, Chen J, Shu Y et al. Correlation of DAPK1 methylation and the risk of gastrointestinal cancer: A systematic review and meta-analysis. Plos One 2017;12:e0184959. 
33. Chrenkov· E, ätudentov· H, Hol· K et al. Castration-resistant prostate cancer monitoring by cell-free circulating biomarkers. Front Oncol 2024;14:1394292. DOI: 10.3389/fonc.2024.1394292 
34. Christensen LL, Holm A, Rantala J et al. Functional screening identifies miRNAs influencing apoptosis and proliferation in colorectal cancer. PLoS One 2014;9(6):e96767. 
35. Liu SL, Sui YF, Lin MZ. MiR-375 is epigenetically downregulated due to promoter methylation and modulates multi-drug resistance in breast cancer cells via targeting YBX1. Eur Rev Med Pharmacol Sci 2016 Jul;20(15):3223-9.

Для цитирования: Покровский В.Е., Федосеев А.Н., Смирнов В.В., Сороколетов С.М. Оценка метилирования группы генов в диагностике гидроторакса Клинический разбор в общей медицине. 2025; 6 (9): 118–120. DOI: 10.47407/kr2025.6.9.00683


Журнал предоставляет свободный доступ с возможностью использовать статьи в некоммерческих целях при условии указания авторства в рамках лицензии CC BY-NC-SA 4.0 (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/deed.ru)

  • О журнале
  • Редколегия
  • Редакционная этика
  • Авторам
  • Плата за публикацию
  • Порядок рецензирования
  • Контакты
   

oa
crossref
анри


  Индексация

Scopus
doaj
elibrary_rus.png

Почтовый адрес издателя

127055, Москва, а/я 37

Адрес редакции

115054, Москва, Жуков пр-д, 19, эт. 2, пом. XI


По вопросам публикаций

+7 (495) 926-29-83

id@con-med.ru